根据中国校友会网（艾瑞深中国校友会网 ）发布的2021中国大学排行榜中，新疆自治区共有16所大学进入排名！
校友会2021中国大学排名评价指标体系由思政教育、教学质量、杰出校友、高层次人才、优势学科专业、科研成果、科研项目、科研基地、社会服务、办学层次、社会声誉、国际影响力等12个一级指标构成，以服务国家“双一流”发展战略和提升高校服务国家地方经济社会发展能力为导向，涵盖中国高校五大核心职能的600多项具有代表性的评测指标，涵盖了国内外其他大学排名的高端质量指标。
其中，新疆自治区大学前三名分别是：新疆大学、石河子大学和新疆医科大学。
和去年相比，新疆医科大学逆袭新疆师范大学进入前三，新疆师范大学跌至第五！
以下是2021年，新疆自治区大学排名榜单：
校友会2021新疆维吾尔自治区大学排名
附前三名大学简介：
新疆大学（Xinjiang University），简称“新大”，位于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐，是1978年确定的全国重点大学，国家“211工程”建设高校、国家西部大开发重点建设高校、中西部高校基础能力建设工程高校、“、”卓越工程师教育培养计划“、”卓越法律人才教育培养计划“、教育部与新疆维吾尔自治区人民政府共建高校，“中西部高校联盟”成员。
新疆大学前身是创办于1924年的新疆俄文法政专门学校。1935年1月改建为新疆学院，1960年10月1日，正式成立新疆大学，1978年被国务院确定为新疆唯一的全国重点大学，1997年被列入国家“211工程”重点建设高校，2000年被确定为国家西部大开发重点建设高校。2000年12月30日，新疆大学与原新疆工学院合并组建新的新疆大学。2004年，学校成为新疆维吾尔自治区人民政府、教育部“区部共建”高校。新疆大学是“中国—中亚国家大学联盟”发起高校及成员。
截至2016年9月，现有校本部、北校区、南校区三个校区，占地面积约4363亩；在校生36684人，其中全日制本科生20518人，成人本专科生9237人，全日制硕士研究生4778人，博士研究生418人，非全日制专业学位研究生993人，留学生740人。
石河子大学位于被誉为戈壁明珠的新疆石河子市，是国家 “211工程”重点大学，是“中西部高校综合实力提升工程”（一省一校）高校和“中西部高校基础能力建设工程”高校，入选“2011计划”、"卓越医生教育培养计划"、"卓越工程师教育培养计划"、"卓越农林人才教育培养计划"，由教育部和新疆生产建设兵团共建，是国家西部重点建设十四所高校之一，“中西部高校联盟”成员。由北京大学、华中科技大学、华东理工大学、华中农业大学、重庆大学、江南大学、对外经济贸易大学、南京师范大学、华南农业大学对口支援石河子大学。
学校现有经济、法、教育、文、历史、理、工、农、医、管理、艺术等11大学科门类。拥有5个一级学科博士学位授权点，涵盖25个二级学科博士学位授权点；23个一级学科硕士学位授权点，144个相关二级学科硕士学位授权点；9种硕士专业学位授权类别，84个本科专业，4个博士后流动站（科研工作站）。
截至2016年4月27日，石河子大学校园面积182万平方米，校舍面积118万平方米，实验室面积15万平方米，绿化覆盖率43%；有附属医院4家；现有在校生40825人，其中普通本科生21697人，普通专科生1125人，国防生392人，硕士、博士研究生3332人。
新疆医科大学，坐落于新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市，是一所省属重点大学，入选“卓越医生教育培养计划”、“中国政府奖学金来华留学生接收院校”，是中华人民共和国国家卫生健康委员会、教育部和新疆自治区共建高校。2011年教育部确定中南大学、吉林大学、北京中医药大学为该校全面对口支援高校，同时还与复旦大学、中山大学、中国药科大学等20余所大学建立了长期援疆共建合作关系。
其前身新疆医学院始建于1954年，1956年建成招生。1998年6月，新疆医学院与新疆中医学院合并成立新疆医科大学。2011年11月4日，国家卫生部与新疆自治区签署了共建该校的协议。
截止2020年12月，学校设有雪莲山校区、新医路校区、鲤鱼山校区、明园校区、仓房沟校区5个校区，雪莲山校区占地2165亩，建筑面积61.59万平方米；有直属附属医院7所，非隶属附属医院6所；下设22个院部，开设26个本科专业，全校教职工16275人（大学1460人，附属医院14815人），现有全日制在校生24433人，其中普通本科生14776人，全日制硕士研究生3951人，博士研究生376人，普通专科生4590人，各层次学历教育留学生740人。
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