上海检验检疫局内设14个职能处室。
1、办公室
2、法制与综合业务处
3、卫生监管处
4、动植物监管处
5、检验鉴定监管处
6、认证监管处
7、食品安全监管处
8、科技处
9、人事处
10、国资处
11、财务处
12、政工处
13、监察审计室
14、离退休干部处
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