新疆农业职业技术学院位于新疆昌吉市，是一所举办高等职业教育的公办全日制普通高等学校，学院是全国首批28所国家示范性高职院校，是新疆首批“高等职业教育与本科教育联合培养应用本科人才”试点高校、现代学徒制试点单位、全国职业教育先进单位、全国毕业生就业典型经验高校。
新疆农业职业技术学院前身是1958年2月创办的昌吉州合作干部学校，2000年6月新疆维吾尔自治区人民政府批准升格为新疆农业职业技术学院
学院设有生物科技分院、园林及食品科技分院、动物科技分院、经济贸易分院、工程分院、信息技术分院、国际合作分院等13个分院，开设有57个专业。
园林科技学院 | 园林工程技术 |
| 食品营养与检测 | |
| 园艺技术 | |
| 植物保护与检疫技术 | |
| 食品加工技术 | |
| 风景园林设计 | |
生物科技学院 | 种子生产与经营 |
| 化工生物技术 | |
| 药品生产技术 | |
| 农产品加工与质量检测 | |
| 药品质量与安全 | |
| 环境工程技术 | |
经济贸易学院 | 会计 |
| 物流管理（农产品方向） | |
| 市场营销 | |
| 酒店管理 | |
| 会展策划与管理 | |
| 电子商务 | |
| 老年服务与管理 | |
| 民政管理 | |
动物科技学院 | 畜牧兽医 |
| 宠物养护与驯导 | |
| 动物防疫与检疫 | |
| 动物医学 | |
| 畜牧兽医（现代马产业技术） | |
| 畜牧工程技术 | |
信息技术学院 | 计算机网络技术 |
| 计算机应用技术 | |
| 软件技术 | |
| 物联网应用技术 | |
| 广告设计与制作 | |
| 数字媒体艺术设计 | |
工程学院 | 建筑工程技术 |
| 工程造价 | |
| 水利工程 | |
| 汽车检测与维修技术 | |
| 机电一体化技术 | |
| 农业装备应用技术 | |
| 电气自动化技术 | |
国际合作学院 | 商务英语 |
| 会计（国际方向） | |
| 商务管理（中亚贸易方向） | |
| 会计（中外合作） | |
| 建筑工程技术（中外合作） | |
| 计算机软件技术（中外合作） |
高水平专业群建设名单：种子生产与经营、畜牧兽医
国家级重点专业：园艺技术、食品加工技术、种子生产与经营、畜牧兽医
自治区级特色专业：水利工程、计算机网络技术、农产品加工与质量检测、动物医学
教育部支持提升专业服务产业能力重点建设专业：动物防疫与检疫、水利工程
自治区支持高等职业学校提升专业服务能力建设项目：农业装备应用技术
自治区畜牧厅重点支持建设专业：现代马产业技术
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