温州大学王牌专业：化学、中国语言文学、电气工程、法学、马克思主义理论、应用经济学、机械工程、生态学、土木工程等。
温州大学浙江省A类一流学科（十三五）
| 学科名称 | 重点级别 | 所属学院 | 学科负责人 |
| 化学 | 省A类一流学科 | 化学与材料工程学院 | 黄少铭 |
| 中国语言文学 | 省A类一流学科 | 人文学院 | 俞为民、颜翔林 |
温州大学浙江省B类一流学科（十三五）
| 学科名称 | 重点级别 | 所属学院 | 学科负责人 |
| 电气工程 | 省B类一流学科 | 数理与电子信息工程学院 | 戴瑜兴 |
| 法学 | 省B类一流学科 | 法政学院 | 邱本 |
| 马克思主义理论 | 省B类一流学科 | 马克思主义学院 | 任映红 |
| 应用经济学 | 省B类一流学科 | 商学院 | 胡振华 |
| 机械工程 | 省B类一流学科 | 机电工程学院 | 薛伟 |
| 生态学 | 省B类一流学科 | 生命与环境科学学院 | 赵敏 |
| 土木工程 | 省B类一流学科 | 建筑与土木工程学院 | 孙林柱 |
温州大学浙江省级重中之重学科（十二五）
| 学科名称 | 重点级别 | 所属学院 | 学科负责人 |
| 化学 | 省重中之重 | 化学与材料工程学院 | 黄少铭 |
温州大学浙江省级重点学科（十二五）
| 学科名称 | 重点级别 | 所属学院 | 学科负责人 |
| 马克思主义中国化研究 | 省重点学科 | 马克思主义学院 | 任映红 |
| 民俗学 | 省重点学科 | 人文学院 | 黄 涛 |
| 应用经济学 | 省重点学科 | 商学院 | 胡振华 |
| 文艺学 | 省重点学科 | 人文学院 | 马大康、颜翔林 |
| 应用数学 | 省重点学科 | 数学与信息科学学院 | 王玮明 |
| 凝聚态物理 | 省重点学科 | 物理与电子信息工程学院 | 杨光参 |
| 生态学 | 省重点学科 | 生命与环境科学学院 | 阎秀峰、赵敏 |
| 电气工程 | 省重点学科 | 物理与电子信息工程学院 | 戴瑜兴 |
| 防灾减灾工程及防护工程 | 省重点学科 | 建筑与土木工程学院 | 蔡袁强 |
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