首都医科大学、北医、协和医学院这几个学校的还是有差别的。
协和医学院目前在国内的总体地位还是无人能及,所以口碑很好,特别是内科专业,还是一如既往的牛,当然心内,心胸外,肿瘤,整形这几个科室地位还是没法撼动,可外科专业在国内就不怎么能排上号了。
北医的整体实力也很不错,有自己特色的专业(自己上网查)。

首都医科大学在国内是个特例,医学院很差,可医院很厉害,虽然说博导和院士等牛人多,但是由于游离在985、211、111之外,所以很多的蛋糕还是无法分享。
结论:结合你自己的专业,如果你是七年制的,还是选个好点的专业,比如天坛、宣武、安贞等等医院的特色专业,先拿到小硕再说,继续考博和工作都是一个不错的出路。
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