水生生物学专业早期以研究水生生物的形态、分类和自然生态为主;其后由于个体生态和种群生态研究的开展，生理学、生物化学概念和方法的引入，特别是1935年，英国科学家A.G.坦斯利提出“生态系统”概念以后，水生生物学也有了较完整的“水生态系统”概念。
全国共有20所招收水生生物学专业研究生的学校参与了排名，其中排名的是中山大学，排名第二的是厦门大学，排名第三的是暨南大学，以下是水生生物学专业考研学校排名具体名单：
| 学校排名 | 学校名称 |
| 1 | 中山大学 |
| 2 | 厦门大学 |
| 3 | 暨南大学 |
| 4 | 华中农业大学 |
| 5 | 上海海洋大学 |
| 6 | 西北农林科技大学 |
| 7 | 南京农业大学 |
| 8 | 南京师范大学 |
| 9 | 华南农业大学 |
| 10 | 同济大学 |
| 11 | 华南师范大学 |
| 12 | 南昌大学 |
| 13 | 西南大学 |
| 14 | 中国海洋大学 |
| 15 | 湖南农业大学 |
| 16 | 清华大学 |
| 17 | 山西大学 |
| 18 | 海南大学 |
| 19 | 东北林业大学 |
| 20 | 陕西师范大学 |
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