清华大学工程物理系的组织机构

工程物理系 核技术研究所 加速器物理及应用研究室 辐射物理与探测研究室 核电子学研究室 粒子信息获取和处理研究室 核系统控制与应用研究室 辐射防护与环境保护研究室 技术物理研究所 同位素分离与应用研究室 离心机械与机电控制研究室 激光分离与光电应用研究室 聚变与等离子体物理研究室 测试技术与仪器研究室 核能科学与工程管理研究所 安全科学与技术研究所 医学物理与工程研究所 近代物理研究所 强子应用及技术中心 粒子技术与辐射成像教育部重点实验室(清华大学) 辐射技术及辐射成像教育部工程研究中心(清华大学) 挂靠工程物理系的校级机构 清华大学高能物理研究中心 清华大学公共安全研究中心 清华大学特种能源研究所 清华大学放射性防护室 清华大学高速铁路技术研究中心 清华大学高能量密度研究中心 清华大学(工物系)-同方威视核技术联合研究所 清华大学(工物系)-上海旺捷机电设备有限公司数字辐射成像研究中心 清华大学(工物系)-辛耕投资有限公司核医学影像联合研究中心 清华大学-波音联合中心 城市综合应急科学北京市重点实验室 清华大学-中固医院投资管理（上海）有限公司临床肿瘤粒子治疗联合研究所 清华大学（工物系）-北京辰安伟业科技有限公司核与辐射应急技术联合研究中心 清华大学（工物系）-中核集团（燃料事业部）技术物理联合研究所 工物系共建校级研究机构 原子分子纳米科学研究中心 清华大学载人航天研究中心 清华大学中国企业成长与经济安全研究中心

清华深研院还是不错的。

清华大学深圳研究生院是清华大学和深圳市合作创建的高层次人才培养基地和科技创新基地，直属清华大学，为清华大学唯一的异地办学机构，是清华大学教育改革的试验田和创建世界一流大学的重要组成部分。

科研平台

根据2014年8月学校官网显示，该校有国家级科研机构6个、省部共建机构1个、省级机构1个、部级机构2个、市级重点实验室10个、市级工程实验室10个。