学校现有10个省级重点学科、4个广西高校重点实验室、1个广西高校重点建设实验室、3个博士后科研流动站。4个一级学科具有硕士学位授予权,39个学科专业具有硕士学位授予权,学科硕士点覆盖率为94.29%;
9、个学科具有博士学位授予权,博士点覆盖率为25.7%。广西医科大学是广西区内第一个获得博士点、第一个博士后科研流动站、广西第一篇博士学位论文入选为全国优秀博士论文、第一个七年制临床医学专业资格的单位,是一所同时拥有学士——硕士——博士——博士后四个培养层次的高等医学学府,是广西医学教育、医学研究、临床医疗和预防保健的中心。2007年广西医科大学学科建设取得2个重大突破:
一是《区域性高发肿瘤早期防治研究》实验室获得省部共建教育部重点实验室,二是肿瘤学获得国家重点(培育)学科。

研究生学院于2003年率先在全区开发和运用广西医科大学研究生教育管理信息系统,内容涵盖了研究生教育从招生、培养、学位授予、思想教育到就业的全过程,2006年开始,管理系统对研究生的培养过程进行适时监控,实现了研究生培养的目标管理过渡到过程管理,研究生每个阶段的教学、实习、科研和导师指导研究生的情况都可以及时在管理系统中体现,使研究生教育管理的全过程已实现了信息化、网络化。
近几年来,随着学位点数量尤其是博士学位授权点不断增加,研究生学院深化改革,勇于开拓创新,在招生、培养、管理方面采取了一系列措施,把提高培养质量放在首位,使学科建设得到较快的发展.学位与研究生教育管理工作日益规范化、科学化、数字化,更加注重研究生政治思想教育工作和研究生业余文化建设、培养提高研究生的综合素质和各种能力,已经成为高层次医学专门人才的培养基地之一。
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