根据新疆农业大学最新招生计划数据查询，新疆农业大学开设专业有动物科学、水产养殖、设施农业科学与工程、林学、园林、园艺、森林保护、林学(含林果病虫害防治方向)、草业科学、环境科学等，具体完整专业名单见下表。
| 院系设置 | 所有专业 |
|---|---|
| 动物科学学院 | 动物科学，水产养殖 |
| 林学与园艺学院 | 设施农业科学与工程，林学，园林，园艺，森林保护，林学(含林果病虫害防治方向) |
| 草业与环境科学学院 | 草业科学，环境科学，农业资源与环境，生态学，地理信息科学 |
| 水利与土木工程学院 | 农业水利工程，工程管理，水土保持与荒漠化防治，农业建筑环境与能源工程，水利水电工程，水文与水资源工程，土木工程 |
| 管理学院 | 人文地理与城乡规划，公共事业管理，人力资源管理，法学，土地资源管理，房地产开发与管理 |
| 化学工程学院 | 应用化学，化学工程与工艺 |
| 食品科学与药学学院 | 食品科学与工程，药学，食品质量与安全，包装工程 |
| 农学院 | 农学，植物保护，生物技术，动植物检疫，种子科学与工程 |
| 经济与贸易学院 | 农林经济管理，会计学，市场营销，经济学，国际经济与贸易，旅游管理，国际商务 |
| 中国语言学院 | 汉语言，中国少数民族语言文学(维吾尔语) |
| 马克思主义学院 | |
| 交通与物流工程学院 | 交通工程，物流工程，交通运输 |
| 动物医学学院 | 动物医学，动物药学，动植物检疫 |
| 计算机与信息工程学院 | 物联网工程，电子信息科学与技术，信息管理与信息系统，计算机科学与技术 |
| 外国语学院 | 英语 |
| 机电工程学院 | 电气工程及其自动化，机械设计制造及自动化，新能源科学与工程，农业机械化及其自动化 |
| 数理学院 | 数学与应用数学 |
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