2017年1月12日，中国科学评价研究中心（RCCSE）、武汉大学中国教育质量评价中心（ECCEQ）和中国科教评价网联合发布了2017年中国大学本科院校综合竞争力总排行榜，共涉及973所中国本科院校，比去年945所高校增加了28所(包括新建、合并、专升本等本科高校)。2017年新疆本科大学排名如下。
2017新疆本科大学排名
2017新疆本科大学排名中，新疆共计10所本科大学进入了全国高职院校排名800强，其中新疆大学排名第一，石河子大学排名第二。
| 排名 | 学校名称 | 总得分 | 省市 | 省市排名 | 类型 | 类型排名 |
| 152 | 新疆大学 | 42.5 | 新疆 | 1 | 综合 | 41 |
| 164 | 石河子大学 | 42.15 | 新疆 | 2 | 综合 | 44 |
| 230 | 新疆医科大学 | 40.29 | 新疆 | 3 | 医药 | 24 |
| 265 | 新疆师范大学 | 39.71 | 新疆 | 4 | 师范 | 33 |
| 286 | 新疆农业大学 | 39.17 | 新疆 | 5 | 农林 | 23 |
| 397 | 新疆财经大学 | 37.76 | 新疆 | 6 | 财经 | 28 |
| 521 | 伊犁师范学院 | 36.81 | 新疆 | 7 | 师范 | 68 |
| 556 | 塔里木大学 | 36.6 | 新疆 | 8 | 农林 | 35 |
| 644 | 喀什大学 | 36.13 | 新疆 | 9 | 师范 | 95 |
| 737 | 昌吉学院 | 35.72 | 新疆 | 10 | 师范 | 126 |
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