纯粹从专业实力看，哈尔滨医科大学的临床医学学科实力略好一点。在2012年教育部组织的学科评估中，哈尔滨医科大学的临床医学学科得分为75分，苏州大学为71分。
不过，在专业实力差距不大的情况下，苏州大学是211、双一流学科建设高校，而且医学方面拥有不同的优势领域，在内科学（血液病）、放射医学、外科学（骨外）方面处于国内拔尖位置，而哈尔滨医科大学的普外科最为突出。如果不是选择普外科方向，还是考虑苏州大学比较好。
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